A Nemzeti Múzeum új épülete nagyon érdekes történettel rendelkezik, mivel először a prágai tőzsdeként szolgált (1938-tól a megszálló csapatok bevonulásáig), majd parlamentként (1946-1992), rádióstúdióként (1995-2009), jelenleg pedig múzeumként funkcionál, kiállítási tárgyait tekintve változatos marad.
A közelmúltban egy földalatti folyosó kötötte össze a közeli Történelmi épülettel, ahol a "Történelem pillanatai" című egyedülálló multimédiás kiállítás látható. Az 1. rész a Vencel téren történt viharos 20. századi eseményeknek van szentelve, míg a 2. rész a tér építészeti fejlődését mutatja be a 19. századtól napjainkig.
Hosszú távú kiállítások az Új épületben
A 20. század története - ismerkedjen meg a cseh modern történelemmel az első világháborútól a Cseh Köztársaság Európai Unióhoz való csatlakozásáig. Az események és emberi sorsok sokféleségét különböző környezetekben mutatják be, bemutatva a terek és utcák fejlődését, a kereskedelmi és kulturális terek átalakulását, valamint a korhűen berendezett lakások magántereit.
A kiállítás betekintést nyújt a cseh és csehszlovák politika változásaiba is. Bemutatja a kulcsfigurákat, valamint a hatalom alapvető döntéseit, amelyek a lakosság minden rétegére hatással voltak.
"Mysarium" - a "Múzeumi egér hosszú éjszakája" című könyv által inspirált pihenőövezet. Itt a fiatal látogatók összeállhatnak Elvíra egérrel és Emil galambbal, és legalább egy időre beléphetnek a színekkel, képzelettel és játékossággal teli világukba.