Il museo è ospitato nell'edificio di Jánský vršek, a pochi passi da via Nerudova, che in passato ospitava il Vinárna U Magistra Kellyho (Enoteca del Maestro Kelly). La mostra si concentra sull'epoca più famosa degli alchimisti, il regno di Rodolfo II.
Il motto del museo è: Molte strade portano alla stregoneria, ma da essa solo una. Quest'unica strada, a quanto pare, è quella che il Dottor Faust ha imboccato per lasciare questo mondo: un buco nel soffitto. Anche questo si trova nella nuova mostra. A parte una piccola mostra sull'alchimia nel Vicolo d'Oro, il nuovo museo è la più grande attrazione che commemora questo affascinante periodo. Un altro ricordo, più modesto, degli alchimisti praghesi si trova nella torre del ponte di Malostranská.
