Muzeul este găzduit în clădirea de pe Jánský vršek, la câțiva pași de strada Nerudova, care a fost în trecut sediul Vinárna U Magistra Kellyho (Barul de vinuri al maestrului Kelly). Expoziția se concentrează pe cea mai faimoasă epocă a alchimiștilor, domnia lui Rudolf al II-lea.
Motto-ul muzeului este: Multe căi duc la vrăjitorie, dar din ea doar una singură. Această singură cale, după cum se pare, este calea pe care doctorul Faust a luat-o din această lume - o gaură în tavan. Și aceasta poate fi găsită în noua expoziție. În afară de o mică expoziție despre alchimie în Golden Lane, noul muzeu este cea mai mare atracție care comemorează această perioadă fascinantă. O altă amintire, mai modestă, a alchimiștilor praghezi poate fi găsită în turnul podului Malostranská.