Maisel Sinagogu'nun inşası, Prag Yahudi Kasabası'nın Belediye Başkanı Mordecai Maisel tarafından, İmparator Rudolf II tarafından verilen ayrıcalığa dayanarak emredildi. Judah Tzoref de Herz ve Josef Wahl tarafından inşa edilen sinagog, dönemi için alışılmadık olan üç nefli bir Rönesans tapınağıydı. Sinagog, 1689'daki getto yangınında yandı ve birkaç kez yeniden inşa edildi. Şu anki Neo-Gotik formunu 1893-1905 yılları arasında Prof. A Grotte'den aldı.
Kalıcı sergi: Bohemya Topraklarındaki Yahudiler, 10. - 18. Yüzyıl
Sergilenen, nadir koleksiyon objelerinin zenginliği, her biri Maisel Sinagogu'nun kapsamlı bir yeniden yapılandırmasının ardından yeni bir düzende ve uygun bir bağlamda yerleştirilmiştir. Dokunmatik ekranlar, ziyaretçilere eski İbranice el yazmalarına göz atma ve Yahudi yerleşimlerinin tarihi haritalarını görüntüleme imkanı sunar. Ziyaretçilerin ayrıca müzenin veritabanında öne çıkan Yahudi figürleri hakkında bilgi aramaları teşvik edilir.
Akşam saatlerinde, sergi alanı sıklıkla bir auditoriuma dönüştürülür ve konserler, resitaller ve solo tiyatro performansları için mekan olarak kullanılır.