Строительство Майзеловой синагоги было заказано Мордехаем Майзелем, мэром пражского еврейского города, на основании привилегии, предоставленной императором Рудольфом II. Построенная Иудой Цорефом де Герцем и Йозефом Валом, она изначально представляла собой ренессансный храм с тремя нефами, что было необычно для своего времени. Синагога сгорела во время пожара в гетто в 1689 году и несколько раз перестраивалась. Свой нынешний неоготический облик она приобрела в 1893-1905 годах по проекту профессора А. Гротте.
Постоянная экспозиция: Евреи в Чешских землях, X-XVIII век
На выставке представлено множество редких коллекционных предметов, каждый из которых после недавней комплексной реконструкции Майзеловой синагоги был помещен в новое расположение и соответствующий контекст. Сенсорные экраны позволяют посетителям просматривать старые рукописи на иврите и исторические карты еврейских поселений. Посетителям также предлагается найти в базе данных музея информацию о выдающихся еврейских деятелях.
В вечерние часы выставочный зал часто превращается в аудиторию и используется в качестве места проведения концертов, сольных театральных представлений.
