Postavená koncom 13. storočia kameňmi zo kráľovskej dielne (ktorí pracovali aj na blízkom kláštore sv. Agnes), je svedectvom dôležitého postavenia vtedajšej židovskej komunity v Prahe. Pôvodne sa nazývala Nová alebo Veľká synagóga, až do založenia ďalších synagóg koncom 16. storočia sa začala nazývať Staronová. Legenda hovorí, že jej základné kamene priniesli anjeli z zničeného chrámu v Jeruzaleme.
Staronová synagóga si získala obrovský rešpekt v pražskom Židovskom meste a v židovských komunitách v zahraničí. Obklopili ju aj mnohé legendy a príbehy. Podľa jednej legendy bola synagóga chránená pred ohňom v ghette krídlami anjelov premenených na holuby, a preto sa až do dnešného dňa zázračne zachovala. Ďalšia legenda hovorí, že podkrovie synagógy je domovom pozostatkov Golema, umelého tvora z hliny, ktorý oživil rabi Loew, aby chránil pražskú komunitu.