I siti del Museo Ebraico si trovano nell'area preservata dell'antica Città Ebraica nel centro storico di Praga, che fa parte del Patrimonio Mondiale dell'UNESCO. La Sinagoga Maisel è la prima parte di una mostra permanente sulla storia degli ebrei in Boemia e Moravia, che offre uno spaccato della storia ebraica nelle terre ceche dai primi insediamenti ebraici nel X secolo fino all'emancipazione alla fine del XVIII secolo.
Il tour del museo comprende anche una visita alle sinagoghe Pinkas, Klausen e Spagnola, alla Sala delle Cerimonie e al famoso Vecchio Cimitero Ebraico. È possibile ritirare l'audioguida con uno sconto del 30% presso il Centro informazioni in Maiselova 15.