Era originalmente um local de oração para a família Horowitz e estava localizado perto de um banho ritual (mikveh). Foi restaurado à sua forma original em 1950-54.
Exposição permanente: Memorial às Vítimas Boémias e Moravias da Holocausto
Em 1955-60 a Sinagoga Pinkas foi transformada num memorial às quase 80.000 vítimas judias da Shoah da Boémia e Morávia. Um dos primeiros memoriais deste tipo na Europa, é o trabalho de dois pintores, Václav Boštík e Jiří John. Após a invasão soviética de 1968, o memorial foi encerrado ao público durante mais de 20 anos. Foi totalmente reconstruído e reaberto ao público em 1995, após a queda do regime comunista.