Budowa synagogi Maisela została zlecona przez Mordechaja Maisela, burmistrza praskiego miasta żydowskiego, na podstawie przywileju nadanego przez cesarza Rudolfa II. Zbudowana przez Judę Tzorefa de Herza i Josefa Wahla, była pierwotnie renesansową świątynią o trzech nawach, co było ewenementem jak na tamte czasy. Synagoga spłonęła w czasie pożaru getta w 1689 r. i była kilkakrotnie odbudowywana. Obecną, neogotycką formę uzyskała w latach 1893-1905, według projektu profesora A. Grotte'a.
Wystawa stała: Żydzi na ziemiach czeskich, X-XIII w.
Na wystawie znajduje się wiele rzadkich obiektów z kolekcji, z których każdy został umieszczony w nowym układzie i odpowiednim kontekście po niedawnej kompleksowej rekonstrukcji synagogi Maisel. Ekrany dotykowe umożliwiają zwiedzającym przeglądanie starych hebrajskich manuskryptów i map historycznych osiedli żydowskich. Zwiedzający są także zachęcani do przeszukiwania muzealnej bazy danych w poszukiwaniu informacji o wybitnych postaciach żydowskich.
W godzinach wieczornych przestrzeń wystawiennicza jest często przekształcana w audytorium, w którym odbywają się koncerty, recitale i solowe przedstawienia teatralne.
